Instytut Systematyki i Ewolucji Zwierząt Polskiej Akademii Nauk (ISEZ PAN) został powołany w 1989 roku na bazie Zakładu Zoologii Systematycznej i Doświadczalnej PAN. Tradycje placówki sięgają jednak roku 1865, kiedy to Towarzystwo Naukowe Krakowskie utworzyło Komisję Fizjograficzną. W tym samym czasie powstało Muzeum Fizjograficzne (obecnie Muzeum Przyrodnicze), które do dziś stanowi integralną część Instytutu.
W naszym Instytucie łączymy tradycyjne kierunki badań, systematykę zwierząt współcześnie żyjących oraz kopalnych, wraz z nowoczesnymi badaniami kariologicznymi i genetycznymi. Nasi pracownicy prowadzą również badania w nowych kierunkach badawczych np. zooarcheologii i ekologii.
Potencjał badawczy Instytutu tworzy 35 pracowników naukowych, w tym 17 pracowników samodzielnych (profesorów i doktorów habilitowanych). Dzięki temu ISEZ PAN posiada uprawnienia do nadawania stopni doktora oraz doktora habilitowanego w dziedzinie nauk biologicznych.
Nasze zbiory liczą ponad 2 miliony okazów bezkręgowców i kręgowców, w tym wiele unikatowych form kopalnych. Instytutowa biblioteka dysponuje jednym z największych w Polsce księgozbiorów zoologicznych, obejmującym ponad 100 tysięcy woluminów.
Od początku istnienia główna siedziba Instytutu mieści się przy ul. Sławkowskiej 17, w bezpośrednim sąsiedztwie Rynku Głównego. Przy ul. św. Sebastiana 9 znajduje się natomiast Muzeum Przyrodnicze ISEZ PAN, gdzie w ramach wystaw stałych prezentowane są wybrane okazy z kolekcji instytutowych.